楼主是今年4月份申请的退税吧，当时我们也是遇到同样的情况。 事情是这样的，我们在2018年6月在泰国注册了一家海外公司用来收外汇，当时由于不了解当地法律又害怕被税局查就选择申请全部退税（包括在泰国的费用跟在新加坡的费用）。 没想到在2019年4月收到了新加坡的税局信，要求我们缴回2017-2018的税。 我们咨询了当地的律师，律师给我们两种方案：一是全额缴税，二是按税局要求的金额缴纳剩下未退税部分的50%。
因为我们的收入是在海外公司下，而开支都在个人名下，难以核对，所以即使交税也只会按最低税额征收。权衡之下选择了第二种方案，就是按50%的比例把剩下的款项汇入税务局指定帐户，然后拿发票报账冲抵。 不过后来我们又想到了一个办法！因为我们公司在2018年在香港还有申报税收，于是我们又在香港申请了部分退税，这样在操作上就可以利用香港退税的钱来填补在新加坡的税收空缺，达到少缴税的目的。（虽然这种做法不道德，但是我们确实是这样操作的）
楼主可以参照一下，希望对你有帮助。
容允戴优质答主新加坡个人所得税计算申报后，税局审核发现少报所得或有其他问题，会发出补税通知（Assessment of Additional Tax），告知欠税多少、理由是什么、以及补税期限。
如果对通知有异议，需要在期限内向税局提出申诉（objection），说明不同意补税的理由和相关支持资料，税局会再次审核决定是否调整应缴税额。
实际中，需要申诉的事项一般不会太复杂，比如某些支出不允许抵扣、某些所得必须计税，多为适用条款问题。申诉结果出来后，如果仍不同意，还可以继续提出上一级评审（review），但实际中很少有用。
税局发出的补税通知，都要在规定期限内（一般是1个月）缴清。如果不是个人原因错过税款缴纳截止期，可以在缴款截止期后的1个月内联系税局安排延期缴纳，税局一般也会酌情考虑。在延期缴款批准后，要按照税局要求一次性缴清。
如果因为个人原因错过税款缴纳截止期，会产生罚息。罚息的计算方式为：欠税从缴款截止期之后的第一个月的1号开始计息，按月计算，利率为拖欠当月1号新加坡浮动基本利率（SFR）再加上8%，利息金额四舍五入取整新币（即小数部分不满1新币的部分不予计算）。
当累计罚息金额达到欠款的20%时，将不再计算利息，而是改为每月追加5%的行政罚金。如果超过一年还不了，会被税局追债（liaison officer），这时就比较麻烦了，追债部门会反复打电话催款、上门调查收入和财产状况，必要时会走法律途径追回欠款（比如法院发传票出庭、申请扣工资、查封变卖财产等）。
所以，新加坡个人所得税，能及时申报缴纳的，还是应该尽早缴清，不要因为一时的拖延心理，而增加了不必要的罚息。
